Flugzeug: Die Fluggesellschaften Compagnie Aerienne du Mali (CAM) und Mali Air Express (MAE) fliegen Inlandsflughäfen wie Mopti, Kayes und Timbuktu an.

Schiff: In der Hochwasserphase des Niger von August bis November/Dezember verkehren drei Fähren der Compagnie Malienne de Navigation (COMANAV) auf dem Fluss zwischen Koulikoro (50 km westlich von Bamako), Mopti, Timbuktu und Gao. Es kann allerdings jederzeit zu Verzögerungen oder Unterbrechungen des Fährservices kommen. Die 1.300 km lange Fahrt dauert etwa 5 bis 7 Tage. Lebensmittel sollte man besser mitbringen, man kann allerdings alles Notwendige auch auf den Schiffen kaufen. Von Dezember bis März, zu Zeiten niedriger Wasserstände auf dem Niger, bedienen die Fähren nur die Strecke zwischen Mopti und Gao. In Timbuktu und Mopti ist es möglich, Pirogues (kleine Boote) und Pinasses (große motorisierte Flussboote) zu mieten.

Bahn: Zwischen Bamako und Kayes fährt täglich ein Zug. Der Komfort in diesen Zügen (Klimaanlage, Speisewagen) ist nicht schlecht. Die "Fahrpläne" werden nie eingehalten, die Reisegeschwindigkeit ist gering. Seit 2003 werden viele Bahnhöfe geschlossen.

Pkw: Die Straßenqualität in Mali ist sehr unterschiedlich, von sehr gut asphaltiert bis durch die Regenzeit unbefahrbar. Die Hauptstrecke in Mali verläuft von Sikasso im Süden nach Bamako, Mopti und Gao. Die straßen nördlich des Niger sind oft sehr schlecht.